Υπάρχουν κατάλοιπα όπως υγρασία, θειάφι και χώμα που κατακάθονται στο πυθμένα της δεξαμενής και προκαλούν πολλά προβλήματα. Γι’αυτό η δεξαμενή θα πρέπει να καθαρίζεται κάθε δυο (2) χρόνια, προκειμένου να απομακρύνονται αυτά τα κατάλοιπα που κάθονται λόγω του ειδικού βάρους στον πυθμένα της. Αν δεν απομακρυνθούν δημιουργούν συνθήκες διάβρωσης, με αποτέλεσμα να υπάρχει πιθανότητα να σκουριάσει και να αναγκαστούμε να προβούμε σε αλλαγή. Επιπλέον υπάρχει περίπτωση να γίνει οξείδωση της δεξαμενής με άμεση συνέπεια το τρύπημα της λαμαρίνας. Ιδιαίτερα προβλήματα και μεγαλύτερη φθορά αντιμετωπίζουν οι πλαστικές δεξαμενές.